Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CatsperbA2RTF1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms