Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl41A2AUC9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl41A2AUC9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms