Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ism1A2ATD1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ism1A2ATD1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms