Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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