Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms