Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Frmpd4A2AFR3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms