Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trav12-2A0N8N6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trav12-2A0N8N6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms