Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc173A0JLY1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms