Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms