Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms