Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H4

Trbv19, T cell receptor beta, variable 19 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv19A0A0B4J1H4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Trbv19A0A0B4J1H4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Trbv19A0A0B4J1H4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Trbv19A0A0B4J1H4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Trbv19A0A0B4J1H4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Trbv19A0A0B4J1H4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Trbv19A0A0B4J1H4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Trbv19A0A0B4J1H4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv19A0A0B4J1H4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Trbv19A0A0B4J1H4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
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