Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrit3W8DXL4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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