Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP2

Vmn2r25, MCG130582, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r25W4VSP2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn2r25W4VSP2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms