Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm4T1NXB5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms