Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z331

Krt6b, Keratin, type II cytoskeletal 6B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6bQ9Z331 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt6bQ9Z331 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt6bQ9Z331 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt6bQ9Z331 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt6bQ9Z331 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt6bQ9Z331 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt6bQ9Z331 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt6bQ9Z331 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt6bQ9Z331 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt6bQ9Z331 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt6bQ9Z331 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt6bQ9Z331 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt6bQ9Z331 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt6bQ9Z331 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt6bQ9Z331 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt6bQ9Z331 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt6bQ9Z331 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt6bQ9Z331 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt6bQ9Z331 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt6bQ9Z331 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt6bQ9Z331 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt6bQ9Z331 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt6bQ9Z331 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt6bQ9Z331 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt6bQ9Z331 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt6bQ9Z331 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt6bQ9Z331 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt6bQ9Z331 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt6bQ9Z331 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt6bQ9Z331 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt6bQ9Z331 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt6bQ9Z331 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt6bQ9Z331 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt6bQ9Z331 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt6bQ9Z331 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt6bQ9Z331 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt6bQ9Z331 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt6bQ9Z331 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt6bQ9Z331 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt6bQ9Z331 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt6bQ9Z331 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt6bQ9Z331 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt6bQ9Z331 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt6bQ9Z331 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt6bQ9Z331 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt6bQ9Z331 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt6bQ9Z331 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms