Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Top3bQ9Z321 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms