Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z309

Cib2, Calcium and integrin-binding family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib2Q9Z309 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cib2Q9Z309 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms