Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W9

Gria3, Glutamate receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria3Q9Z2W9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gria3Q9Z2W9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gria3Q9Z2W9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms