Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Mrpl40Q9Z2Q5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Mrpl40Q9Z2Q5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Mrpl40Q9Z2Q5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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Mrpl40Q9Z2Q5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl40Q9Z2Q5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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