Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms