Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms