Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ap3b1Q9Z1T1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms