Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q5

Clic1, Chloride intracellular channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic1Q9Z1Q5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clic1Q9Z1Q5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clic1Q9Z1Q5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms