Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx39bQ9Z1N5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms