Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema4fQ9Z123 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema4fQ9Z123 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms