Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Hmg20bQ9Z104 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Hmg20bQ9Z104 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Hmg20bQ9Z104 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Hmg20bQ9Z104 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Hmg20bQ9Z104 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Hmg20bQ9Z104 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Hmg20bQ9Z104 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Hmg20bQ9Z104 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Hmg20bQ9Z104 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hmg20bQ9Z104 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hmg20bQ9Z104 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hmg20bQ9Z104 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hmg20bQ9Z104 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hmg20bQ9Z104 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hmg20bQ9Z104 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Hmg20bQ9Z104 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hmg20bQ9Z104 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hmg20bQ9Z104 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hmg20bQ9Z104 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmg20bQ9Z104 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmg20bQ9Z104 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmg20bQ9Z104 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmg20bQ9Z104 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmg20bQ9Z104 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmg20bQ9Z104 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmg20bQ9Z104 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmg20bQ9Z104 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmg20bQ9Z104 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmg20bQ9Z104 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmg20bQ9Z104 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmg20bQ9Z104 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmg20bQ9Z104 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmg20bQ9Z104 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmg20bQ9Z104 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmg20bQ9Z104 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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