Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms