Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Skp1Q9WTX5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Skp1Q9WTX5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Skp1Q9WTX5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Skp1Q9WTX5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Skp1Q9WTX5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Skp1Q9WTX5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Skp1Q9WTX5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Skp1Q9WTX5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Skp1Q9WTX5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Skp1Q9WTX5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Skp1Q9WTX5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Skp1Q9WTX5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skp1Q9WTX5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skp1Q9WTX5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skp1Q9WTX5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skp1Q9WTX5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skp1Q9WTX5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skp1Q9WTX5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skp1Q9WTX5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skp1Q9WTX5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skp1Q9WTX5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skp1Q9WTX5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skp1Q9WTX5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skp1Q9WTX5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skp1Q9WTX5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Skp1Q9WTX5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Skp1Q9WTX5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms