Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Sema6cQ9WTM3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Sema6cQ9WTM3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sema6cQ9WTM3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sema6cQ9WTM3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sema6cQ9WTM3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sema6cQ9WTM3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sema6cQ9WTM3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sema6cQ9WTM3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sema6cQ9WTM3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sema6cQ9WTM3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sema6cQ9WTM3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6cQ9WTM3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6cQ9WTM3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6cQ9WTM3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6cQ9WTM3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6cQ9WTM3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6cQ9WTM3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6cQ9WTM3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6cQ9WTM3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6cQ9WTM3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6cQ9WTM3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6cQ9WTM3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6cQ9WTM3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6cQ9WTM3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6cQ9WTM3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6cQ9WTM3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6cQ9WTM3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6cQ9WTM3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6cQ9WTM3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6cQ9WTM3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6cQ9WTM3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6cQ9WTM3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6cQ9WTM3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6cQ9WTM3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6cQ9WTM3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms