Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTK0

Nupr1, Nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nupr1Q9WTK0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nupr1Q9WTK0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms