Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpc2Q9R244 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms