Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms