Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NrkQ9R0G8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NrkQ9R0G8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NrkQ9R0G8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NrkQ9R0G8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NrkQ9R0G8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NrkQ9R0G8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NrkQ9R0G8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NrkQ9R0G8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NrkQ9R0G8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NrkQ9R0G8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NrkQ9R0G8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NrkQ9R0G8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NrkQ9R0G8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NrkQ9R0G8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NrkQ9R0G8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NrkQ9R0G8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NrkQ9R0G8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NrkQ9R0G8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NrkQ9R0G8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NrkQ9R0G8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NrkQ9R0G8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NrkQ9R0G8 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NrkQ9R0G8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NrkQ9R0G8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NrkQ9R0G8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NrkQ9R0G8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NrkQ9R0G8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NrkQ9R0G8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NrkQ9R0G8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NrkQ9R0G8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NrkQ9R0G8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NrkQ9R0G8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NrkQ9R0G8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NrkQ9R0G8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NrkQ9R0G8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.6
NrkQ9R0G8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NrkQ9R0G8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms