Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plod1Q9R0E2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plod1Q9R0E2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms