Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Plod3Q9R0E1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Plod3Q9R0E1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms