Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms