Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nek3Q9R0A5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nek3Q9R0A5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nek3Q9R0A5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nek3Q9R0A5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nek3Q9R0A5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nek3Q9R0A5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nek3Q9R0A5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nek3Q9R0A5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nek3Q9R0A5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nek3Q9R0A5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nek3Q9R0A5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nek3Q9R0A5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nek3Q9R0A5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nek3Q9R0A5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nek3Q9R0A5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nek3Q9R0A5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nek3Q9R0A5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nek3Q9R0A5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nek3Q9R0A5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nek3Q9R0A5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nek3Q9R0A5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nek3Q9R0A5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nek3Q9R0A5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nek3Q9R0A5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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