Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms