Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Gpc1Q9QZF2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc1Q9QZF2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc1Q9QZF2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Gpc1Q9QZF2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc1Q9QZF2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Gpc1Q9QZF2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc1Q9QZF2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Gpc1Q9QZF2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Gpc1Q9QZF2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Gpc1Q9QZF2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc1Q9QZF2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc1Q9QZF2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc1Q9QZF2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc1Q9QZF2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc1Q9QZF2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc1Q9QZF2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc1Q9QZF2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc1Q9QZF2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Gpc1Q9QZF2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Gpc1Q9QZF2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Gpc1Q9QZF2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gpc1Q9QZF2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc1Q9QZF2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc1Q9QZF2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc1Q9QZF2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc1Q9QZF2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc1Q9QZF2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc1Q9QZF2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc1Q9QZF2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gpc1Q9QZF2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc1Q9QZF2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gpc1Q9QZF2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms