Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms