Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a3Q9QZB6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms