Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms