Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Six6Q9QZ28 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Six6Q9QZ28 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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