Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms