Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SrfQ9JM73 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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