Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkd2l2Q9JLG4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms