Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC3

Msrb1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb1Q9JLC3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Msrb1Q9JLC3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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