Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Gde1Q9JL56 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Gde1Q9JL56 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Gde1Q9JL56 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Gde1Q9JL56 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Gde1Q9JL56 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Gde1Q9JL56 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gde1Q9JL56 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms