Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL18

Bace2, Beta-secretase 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace2Q9JL18 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bace2Q9JL18 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms