Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chrac1Q9JKP8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms